科里·奥赫恩(Corey O’Hern)实验室的染色质图像。
揭开染色质的神秘面纱-一种RNA,DNA和蛋白质的混合物,可以包装和保护DNA-可以带来有关基因调控和基因组以及癌症和其他疾病的重要见解。
耶鲁大学的三名研究人员将工程,生物学和物理学相结合,获得了美国国家科学基金会(NSF)的四年资助,用于研究酵母细胞中的染色质。他们的目的是更好地了解染色质的特性,并利用基因组作为测量和记录动态,瞬时染色质状态的设备。
来自研究与创新新兴领域(EFRI)计划的赠款,为该项目提供了200万美元的资金。对于2018年EFRI赠款,NSF寻求研究染色质和表观遗传工程的跨学科方法的提案。
染色质运动
Corey O’Hern,Megan King和Simon Mochrie将在该项目上进行合作。他们旨在开发一种新颖的方法来将瞬时染色质构象记录为基因组本身中的“记忆”。
细胞生物学副教授金说:“我们不得不思考如何使我们的研究超出对基本生物学的更好理解。”“我们希望使用染色质作为实际工程设计的工具。”
为了有意地对基因组进行工程改造并将其用作能够将动态染色质状态与生化输入整合在一起的存储设备,研究人员表示,他们需要能够探测和解释染色质动力学的系统,而这是当前研究中所缺乏的。通过开发这样的系统,研究人员将能够将染色质的计算模型和理论模型与实验进行比较。
除其他可能性外,这种系统可用于定位药物并将其递送至转移细胞。
物理学和应用物理学教授King和Mochrie长期合作进行染色质研究。机械工程与材料科学,物理学和应用物理学教授O'Hern将开发染色质的计算模型。
King说:“我们擅长生成实验数据,但我们需要建模和仿真才能理解这些数据在告诉我们什么。”
这三位科学家是由于参加耶鲁大学雷蒙德分校和贝弗利·萨克勒研究所(RBSI)的生物,物理和工程科学研究而聚集在一起的。
奥赫恩说:“细胞生物学和物理学是该项目的重要组成部分,但如果不是研究所的话,工程不会涉及到。”
金说:“有很多大学对建立跨学科的合作感兴趣,但是它们是由管理员自上而下地创建的。”“这里的计划始于许多真实,有意义的合作,我认为这是RBSI如此成功的原因之一。”
莫奇里说:“我们有机会开展跨学科,融合研究,对此我们感到非常兴奋。”“该奖项确实证明了RBSI在过去10年中推动的跨学科合作价值。”
成立于2007年的EFRI致力于激发并帮助研究人员扩大知识范围,以应对巨大的工程挑战和国家需求。