数学关系揭示了癌细胞突变的速率

耶鲁公共卫生学院的研究人员发现了一种数学关系，揭示了癌细胞变异的速率以及为什么有些生存和迅速繁殖的速度，其他人没有。

杰弗里Townsend，博士，博士，生态学和进化生物学教授博士，博士议员的发现将允许进行必要的计算，以确定癌细胞的可能性。

该发现对精密医学肿瘤板的决策，临床试验的选择和设计，制药和基础研究优先级的决策有影响。

该研究发表于国家癌症研究所。

“在过去的10年里，我们能够从肿瘤测序计算突变的基因是赢家和输家 - 哪种突变的基因有助于癌症生存并繁殖，而且没有任何作用，”Townsend表示。“但我们无法计算他们的癌症效应大小 - 将一个突变与另一个突变进行比较。现在我们可以。“

癌症生物学的主要目标是不仅仅是鉴定癌症发育的重要和不重要的基因，而是确定每种细胞突变对癌细胞的存活率和传播的相对重要性，最终是对患者的意义Townsend解释说。

在研究中，研究人员估计了22种主要类型癌症中所有复发单核苷酸变体的效果大小，并量化了每个癌症的相对重要性。

肿瘤测序研究通常报告了如何看到频繁的突变以及表明该基因是否具有超出预期的突变，这两个重要措施的统计测量（P值）。然而，既不是癌症的效果大小。既不是衡量基因对肿瘤引发和癌症病的重要性程度。为了量化癌症效果规模，Townsend和同事突破了肿瘤中突变的频率分为两种贡献因素：基线突变率，以及癌症谱系中突变的选择程度。突变和选择都有助于细胞之间变体的频率。Townsend和同事能够使用Perse Genome-Scale数据来计算突变率。通过基本上介绍从肿瘤中观察到突变的突变的突变的贡献，他们展示了如何计算癌症效应大小

Townsend积分突破进化生物学中的背景的洞察力。“在癌症世界中，重点一直是突变率，在进化生物学中的重点是对这些突变的自然选择过程。他说，癌症效应大小的量化是跨学科研究如何有助于，但对科学进步至关重要。“

为什么癌症效应大小重要？Townsend使用肿瘤的一个例子，DNA序列表明已知与癌症有关的两个基因已突变。有两种高效的药物靶向这些确切突变，但没有进行临床试验以比较它们。

“通过观察癌症通过进化镜头，我们可以利用通过肿瘤DNA测序可用的分子数据的财富，以更好地了解驱动癌症并扩大和改进进化理论，”文森特·克兰特·博士说。 ，博士后助理和研究的第一作者。

该研究由斯蒂芬盖夫尼，博士学位，耶鲁公共卫生学院的副研究科学家博士共同撰写。该研究由Gilead Sciences，Inc。的授予资助

出版物：Vincent L Cannataro，等，“癌症中躯体突变的影响”，“国家癌症研究所，2018年; DOI：10.1093 / JNCI / DJY168