一项与癌症有关的基因中近千种变异的大规模研究可以帮助查明罹患乳腺或卵巢肿瘤风险的人。
迫切需要这些信息:数百万人对其BRCA1基因进行了测序。BRCA1 DNA序列的某些变异与乳腺癌和卵巢癌有关;其他人被认为是安全的。但是大多数变体的作用尚不清楚,患者和医生都无法理解结果。
这项研究于9月12日在Nature1上发表,研究了数千种此类变体对实验室中生长的细胞存活的影响。这些发现可以帮助医生解释突变的意义。例如,在实验室中妨碍细胞修复DNA能力的变异体也可能与临床癌症有关。
每个病人都是不同的。华盛顿西雅图市Brotman Baty精密医学研究所的遗传学家杰伊·申杜尔(Jay Shendure)说,每个医生都是不同的。如果我的家庭成员中有这种变体,我会使用此信息吗?绝对。否则,没有信息。
不确定的未来
美国医学遗传学和基因组学学院认识到大约60个基因,对其进行筛查可能暗示一种预防或减少疾病影响的医疗计划。然而,当人们发现他们的基因包含不寻常的DNA序列时,他们往往会无所适从地解释这一发现。
佛罗里达坦帕市莫菲特癌症中心的遗传学家阿尔瓦罗·蒙泰罗(Alvaro Monteiro)说,“这些变异是噩梦般的”。结果是:“好,您有东西,但是我们只是不知道它到底是什么。”
麻省理工学院广泛研究所和哈佛大学遗传学家海蒂·雷姆(Heidi Rehm)说,对听力损失的遗传原因进行分析的方法就是一个很好的例子:大约有一半的接受这种检测的人发现他们携带的变异体的意义尚不清楚。 。她说:“这在所有基因检测领域都是一个明确的挑战。”
对于BRCA1来说,风险尤其高:BRCA1序列使她们处于患癌风险的女性有时会“缩口手术”去除乳房和卵巢。Rehm说,BRCA1中有2500多个已知意义不确定的变体。
铸网
Shendure和Brotman Baty研究所的遗传学家Lea Starita决定使用没有功能的BRCA1蛋白而死亡的细胞来解决这个问题,而该蛋白对DNA修复很重要。他们利用CRISPR'as9基因编辑技术在整个BRCA1基因中产生了突变,然后研究了最终产生的细胞中哪些存活。
该筛查覆盖了BRCA1区域中几乎所有可能的单字母变异,已知该变异对其相关蛋白的功能很重要。在可获得临床数据的情况下,超过96%的时间,实验室结果与临床发现相关。
该方法可以扩展到其他一些与疾病相关的基因,特别是对DNA修复很重要的癌症相关基因。蒙泰罗锘说?
理想情况下,这些数据将与有关给定变体的其他遗传信息结合在一起,但是对于稀有序列可能无法获得更多数据?在这种情况下,由患者及其医师决定如何解释结果,Starita说。她指出,有些人可能选择进行进一步的癌症筛查,以尽早发现肿瘤。
蒙特罗说,最终,研究人员可能会将实验室结果,例如从CRISPR筛选中获得的结果,直接整合到他们用于对变体进行分类的模型中。但是他也认为该领域趋于保守,并且可能需要更多的证据才能做出改变。
他说:“这是一个非常棘手的话题。”“当我们一次尝试对变体进行分类时,我们真的很喜欢这个决定永远不会再改变。”?/ p>